Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB15P59190 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB15P59190 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms