Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MTCP1P56278 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms