Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPTEP56180 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPTEP56180 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPTEP56180 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPTEP56180 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPTEP56180 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPTEP56180 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPTEP56180 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TPTEP56180 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TPTEP56180 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms