Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAG2P55895 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RAG2P55895 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RAG2P55895 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAG2P55895 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAG2P55895 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAG2P55895 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAG2P55895 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAG2P55895 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAG2P55895 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAG2P55895 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RAG2P55895 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms