Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNU13P55769 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms