Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD23AP54725 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms