Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP12AP54707 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms