Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CRISP1P54107 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms