Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGGT1BP53609 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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PGGT1BP53609 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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PGGT1BP53609 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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PGGT1BP53609 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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PGGT1BP53609 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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PGGT1BP53609 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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PGGT1BP53609 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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PGGT1BP53609 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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PGGT1BP53609 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGGT1BP53609 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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