Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms