Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLK1P49759 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLK1P49759 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms