Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRIM1P49642 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms