Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NESP48681 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NESP48681 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NESP48681 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NESP48681 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NESP48681 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NESP48681 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NESP48681 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NESP48681 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NESP48681 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NESP48681 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NESP48681 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NESP48681 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NESP48681 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NESP48681 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NESP48681 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NESP48681 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NESP48681 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NESP48681 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NESP48681 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NESP48681 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NESP48681 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NESP48681 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NESP48681 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
NESP48681 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
NESP48681 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NESP48681 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NESP48681 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NESP48681 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NESP48681 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NESP48681 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NESP48681 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NESP48681 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NESP48681 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NESP48681 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NESP48681 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NESP48681 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NESP48681 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NESP48681 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NESP48681 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NESP48681 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NESP48681 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NESP48681 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms