Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PIP4K2AP48426 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms