Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RECQLP46063 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RECQLP46063 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RECQLP46063 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RECQLP46063 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RECQLP46063 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RECQLP46063 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RECQLP46063 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RECQLP46063 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RECQLP46063 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RECQLP46063 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RECQLP46063 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RECQLP46063 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RECQLP46063 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RECQLP46063 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RECQLP46063 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RECQLP46063 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RECQLP46063 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RECQLP46063 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RECQLP46063 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RECQLP46063 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RECQLP46063 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RECQLP46063 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RECQLP46063 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RECQLP46063 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RECQLP46063 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RECQLP46063 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms