Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPAP38571 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPAP38571 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPAP38571 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPAP38571 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPAP38571 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPAP38571 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPAP38571 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPAP38571 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPAP38571 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPAP38571 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPAP38571 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPAP38571 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPAP38571 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPAP38571 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPAP38571 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPAP38571 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms