Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM23P36406 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM23P36406 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms