Protein–RNA interactions for Protein: P35789

ZNF93, Zinc finger protein 93, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF93P35789 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF93P35789 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms