Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPN7P35236 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms