Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP6P35125 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP6P35125 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP6P35125 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP6P35125 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP6P35125 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP6P35125 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP6P35125 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP6P35125 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP6P35125 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP6P35125 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP6P35125 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP6P35125 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP6P35125 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP6P35125 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP6P35125 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP6P35125 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP6P35125 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP6P35125 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms