Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD40LGP29965 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms