Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PEX2P28328 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms