Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NFKBIAP25963 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NFKBIAP25963 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms