Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LMO1P25800 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LMO1P25800 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LMO1P25800 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LMO1P25800 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LMO1P25800 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LMO1P25800 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LMO1P25800 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LMO1P25800 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LMO1P25800 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LMO1P25800 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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