Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRR1P24046 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRR1P24046 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms