Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HRCP23327 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HRCP23327 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HRCP23327 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HRCP23327 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
HRCP23327 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HRCP23327 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms