Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CXCL3P19876 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CXCL3P19876 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CXCL3P19876 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CXCL3P19876 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CXCL3P19876 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CXCL3P19876 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCL3P19876 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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