Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CXCL2P19875 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms