Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB9P17482 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms