Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms