Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHGAP10645 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHGAP10645 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHGAP10645 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHGAP10645 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHGAP10645 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHGAP10645 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHGAP10645 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHGAP10645 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHGAP10645 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHGAP10645 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHGAP10645 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHGAP10645 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHGAP10645 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHGAP10645 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHGAP10645 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHGAP10645 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHGAP10645 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHGAP10645 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHGAP10645 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms