Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GLI3P10071 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GLI3P10071 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GLI3P10071 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GLI3P10071 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GLI3P10071 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GLI3P10071 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GLI3P10071 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GLI3P10071 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms