Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms