Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC159P0C7I6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms