Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA5P08648 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms