Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEFLP07196 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEFLP07196 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEFLP07196 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms