Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PF4P02776 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PF4P02776 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PF4P02776 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms