Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-HP01893 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms