Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA3O96018 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA3O96018 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA3O96018 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA3O96018 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA3O96018 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA3O96018 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA3O96018 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APBA3O96018 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APBA3O96018 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APBA3O96018 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APBA3O96018 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APBA3O96018 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APBA3O96018 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms