Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYF2O95926 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYF2O95926 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYF2O95926 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms