Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf47O95873 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms