Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPBO95292 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VAPBO95292 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAPBO95292 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPBO95292 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPBO95292 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPBO95292 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPBO95292 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPBO95292 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPBO95292 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPBO95292 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPBO95292 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAPBO95292 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms