Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOL3O95236 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOL3O95236 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms