Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBBP9O75884 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBBP9O75884 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms