Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 WDR27-208ENST00000479310 1289 ntTSL 520.19■□□□□ 0.824e-6■■■■■ 119.8
SF3B1O75533 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 119.8
SF3B1O75533 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -04e-6■■■■■ 119.8
SF3B1O75533 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 119.8
SF3B1O75533 POM121C-201ENST00000398379 715 ntTSL 29.45□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 119.8
SF3B1O75533 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 119.7
SF3B1O75533 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 EXOC4-219ENST00000486013 1600 ntTSL 510.05□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 ATG4D-209ENST00000588857 1555 ntTSL 1 (best)23.56■■□□□ 1.363e-6■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 ATG4D-208ENST00000588667 1619 ntTSL 1 (best)21.8■■□□□ 1.083e-6■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 ATG4D-204ENST00000586417 1752 ntTSL 221.4■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 ATG4D-203ENST00000585752 729 ntTSL 520.53■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 PATL1-202ENST00000531919 440 ntTSL 51.66□□□□□ -2.141e-6■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.416e-6■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.617e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.437e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.317e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 DECR2-216ENST00000633348 762 ntTSL 322.69■■□□□ 1.227e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.137e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 DECR2-217ENST00000633923 509 ntTSL 321.22■□□□□ 0.997e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 DECR2-206ENST00000445291 1078 ntTSL 520.91■□□□□ 0.947e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 DECR2-205ENST00000439661 1618 ntTSL 220.3■□□□□ 0.847e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.847e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 DECR2-204ENST00000437024 1738 ntTSL 220.05■□□□□ 0.87e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.787e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 FKBP8-202ENST00000544835 1292 ntTSL 1 (best)19.76■□□□□ 0.757e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 FKBP8-211ENST00000601844 1548 ntTSL 518.65■□□□□ 0.587e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.347e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.217e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 DECR2-215ENST00000633025 561 ntTSL 515.95■□□□□ 0.147e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 TRIM65-205ENST00000591668 644 ntTSL 213.58□□□□□ -0.247e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 VTA1-203ENST00000452973 3177 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.487e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 CCNB2-204ENST00000561077 687 ntTSL 511.09□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 ST6GAL1-204ENST00000423451 602 ntTSL 410.97□□□□□ -0.654e-6■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 TRIM65-206ENST00000592642 396 ntTSL 310.76□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 POC1B-207ENST00000547496 1392 ntTSL 210.33□□□□□ -0.767e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 VTA1-205ENST00000620996 3272 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.777e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 VTA1-201ENST00000367621 1284 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.817e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 ST6GAL1-210ENST00000446170 588 ntTSL 49.71□□□□□ -0.864e-6■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 POC1B-208ENST00000548715 829 ntTSL 59.29□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.197e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.377e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 ST6GAL1-202ENST00000416235 577 ntTSL 25.03□□□□□ -1.64e-6■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 POC1B-204ENST00000546740 911 ntTSL 24.69□□□□□ -1.667e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 ST6GAL1-208ENST00000440338 568 ntTSL 44.29□□□□□ -1.724e-6■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.067e-7■■■■■ 119.6
SF3B1O75533 MUS81-213ENST00000530928 1793 ntTSL 220.36■□□□□ 0.852e-9■■■■■ 119.5
SF3B1O75533 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 516.5■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 119.5
SF3B1O75533 TNRC18-206ENST00000434361 577 ntTSL 317.55■□□□□ 0.45e-6■■■■■ 119.5
SF3B1O75533 RUNX1-216ENST00000482318 1710 ntTSL 1 (best)23.03■■□□□ 1.283e-6■■■■■ 119.5
SF3B1O75533 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 119.5
SF3B1O75533 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 119.5
SF3B1O75533 EXOC4-217ENST00000483800 559 ntTSL 47.33□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 119.5
SF3B1O75533 KDM2B-216ENST00000543025 2522 ntTSL 1 (best)16.99■□□□□ 0.318e-7■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.158e-7■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.38e-7■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 SLC39A11-205ENST00000579319 439 ntTSL 311.82□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 PIBF1-208ENST00000617689 2882 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.083e-8■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 SLC39A11-211ENST00000581581 386 ntTSL 35.21□□□□□ -1.583e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 DDX11-208ENST00000536265 3603 ntTSL 511.8□□□□□ -0.524e-8■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 DDX11-213ENST00000539049 3471 ntTSL 511.31□□□□□ -0.64e-8■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 DDX11-201ENST00000228264 3717 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.684e-8■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 DDX11-204ENST00000435753 4182 ntTSL 510.3□□□□□ -0.764e-8■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 DDX11-202ENST00000350437 3724 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.774e-8■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 DDX11-229ENST00000545668 3751 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.844e-8■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 FAM49B-213ENST00000519142 696 ntTSL 54.48□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 TNIK-206ENST00000460047 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.564e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 TNIK-214ENST00000488470 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.744e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 TNIK-203ENST00000357327 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.824e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 TNIK-211ENST00000475336 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.844e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.064e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 MCM7-209ENST00000485286 2900 ntTSL 218.44■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)10.42□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 ATG4D-212ENST00000590096 1282 ntTSL 523.11■■□□□ 1.294e-6■■■■■ 119.4
SF3B1O75533 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.212e-7■■■■■ 119.3
SF3B1O75533 UMAD1-207ENST00000638342 941 ntTSL 519.66■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 119.3
SF3B1O75533 UMAD1-209ENST00000639343 2368 ntTSL 511.96□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 119.3
SF3B1O75533 UMAD1-208ENST00000639110 2386 ntTSL 511.96□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 119.3
SF3B1O75533 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 119.3
SF3B1O75533 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.594e-6■■■■■ 119.3
SF3B1O75533 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 119.2
SF3B1O75533 GFM2-203ENST00000427854 1870 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 119.2
SF3B1O75533 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 119.2
SF3B1O75533 CLASP1-207ENST00000452274 3966 ntTSL 59.17□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 119.1
SF3B1O75533 VPS13D-201ENST00000011700 10969 ntTSL 1 (best)6.46□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 119.1
SF3B1O75533 APBA2-201ENST00000382938 1954 ntTSL 216.05■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 119.1
SF3B1O75533 KIAA1109-204ENST00000419325 4967 ntTSL 1 (best)3.79□□□□□ -1.82e-6■■■■■ 119.1
SF3B1O75533 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 119
SF3B1O75533 RALY-205ENST00000442805 871 ntTSL 528.36■■■□□ 2.132e-6■■■■■ 119
SF3B1O75533 RALY-206ENST00000448364 1204 ntTSL 226.66■■□□□ 1.862e-6■■■■■ 119
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1776.8 ms