Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIN3BO75182 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms