Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD4O60885 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD4O60885 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD4O60885 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD4O60885 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD4O60885 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD4O60885 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD4O60885 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD4O60885 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD4O60885 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD4O60885 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD4O60885 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms