Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms