Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYNGR3O43761 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms