Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KCNQ3O43525 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ3O43525 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms